KDVK Md.29/2 uyarınca; Bakanlar Kurulu tarafından vergi nispeti indirilen teslim ve hizmetlerle ilgili olup teslim ve hizmetin gerçekleştiği vergilendirme döneminde indirilemeyen ve tutarı Bakanlar Kurulunca tespit edilecek sınırı aşan vergi, bu mükelleflerin vergi ve sosyal sigorta prim borçları ile genel ve katma bütçeli idareler ile belediyelere olan borçlarına ya da döner sermayeli kuruluşlar ile sermayesinin % 51'i veya daha fazlası kamuya ait olan veya özelleştirme kapsamında işletmeler ile organize sanayi bölgelerinden temin ettikleri mal ve hizmet bedellerine ilişkin borçlarına mahsuben ödenir. Yılı içinde mahsuben iade edilemeyen vergi izleyen yıl içinde talep edilmesi şartıyla nakden veya mükellefin yukarıda sayılan borçlarına mahsuben iade edilir.
KDV Genel Uygulama Tebliği'nde indirimli orana tabi işlemlerde iade uygulamasının usul ve esasları açıklanmıştır. Tebliğin "Yılı İçinde Mahsup Edilemeyen Vergilerin İadesi" başlıklı bölümünde; indirimli orana tabi işlemlerden doğan KDV iade alacağının yılı içinde mahsuben iade edilemeyen kısmının, izleyen yıl içinde mükellefin isteğine bağlı olarak, nakden veya mahsuben iade edilebileceği, iade talebinin, en erken izleyen yılın Ocak dönemine ait olup Şubat ayı içinde verilecek, en geç Kasım dönemine ait olup Aralık ayı içinde verilecek KDV beyannamesi ile yapılması gerektiği, süresinde iade hakkını kullanmayan mükelleflerin, daha sonra düzeltme beyannameleri vermek suretiyle iade talebinde bulunmalarının mümkün olmadığı ifade edilmiştir.
Diğer taraftan, izleyen yıl içerisinde talep edilen iade tutarının aynı yıl içerisinde düzeltme beyannamesi ile artırılması mümkündür. Ancak bu durumda artırılan kısmın iadesi münhasıran vergi inceleme raporuna göre yerine getirilecektir.
Dolayısıyla, 2013 takvim yılında gerçekleşen indirimli orana tabi işlemler nedeniyle doğan KDV iadesi için son başvuru tarihi 2014 yılı Kasım ayı KDV beyanının yapılması gereken 24.12.2013 günü olmaktadır. Söz konusu iade talebi Kasım 2013 dönemi KDV beyannamesiyle yapılacaktır. En geç bu tarihe kadar iade talebinde bulunmayan mükellefler bu haklarını kaybedeceklerdir. İade talebinin bu süre içerisinde yapılmaması halinde daha sonra düzeltme beyannamesi ile iade talebinde bulunulması da mümkün değildir.
